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                  DNA提取方法的總結(jié)!
                  更新時間:2019-10-25瀏覽:2395次

                  DNA提取方法的一些總結(jié):

                  細菌DNA的提取:
                  (一)
                  試劑:
                  1. 抽提緩沖液
                  2% CTAB (W/V)
                  2% PVP K25 (w/v) (去色素)
                  100mM Tris-HCl (pH8.0)
                  25mM EDTA (pH8.0)
                  2.0M NaCl
                  2.10M LiCl
                  3. 2M LiCl
                  4.DEPC-water(抑制RNA酶活性)
                  5. 3M NaAc (pH5.2)
                  6. 96% 乙醇
                  7. 70% 乙醇
                  步驟:
                  1.抽提緩沖液65℃預(yù)熱;
                  2. 加菌體到已經(jīng)預(yù)熱的緩沖液(700ul)中混勻,65℃,10min;
                  3. 加酚/LV仿/異戊醇(25:24:1),振蕩,離心12,000rpm,10min;
                  4.取上清,加LV/異戊醇(24:1)振蕩,離心12,000rpm,10min;
                  5. 取上清,重復(fù)4步驟;
                  6. 加入1/10體積的3M醋酸鈉和1.5倍體積的乙醇(或加入等體積的異丙醇),-20C沉淀;
                  11. 離心12,000rpm,10min;
                  12. 棄上清,70%乙醇洗,也可以再用100%乙醇洗,然后溶解于100ml 水中。
                  (二)(我們常用的方法,但是有時有些細菌特別不好提,就用上面的方法)
                  1. 將菌株接種于液體LB培養(yǎng)基,37℃震蕩培養(yǎng)過夜。
                  2. 取1.5ml培養(yǎng)物12000rpm離心2min。
                  3. 沉淀物加入567 ul的TE緩沖液,反復(fù)吹打使之重新懸浮,加入30ul 10%SDS和15ul的蛋白酶K,混勻,于37℃溫育1h.
                  4. 加入100ul 5mol/L NaCl, 充分混勻,再加入80ul CTAB/NaCl溶液,混勻后再65℃溫育10min。
                  5. 加入等體積的酚/LV/異戊醇混勻,離心4-5min, 將上清轉(zhuǎn)入一只新管中,加入0.6-0.8倍體積的異丙醇,輕輕混合直到DNA沉淀下來,沉淀可稍加離心。
                  6. 沉淀用1ml的70%乙醇洗滌后,離心棄乙醇.
                  真菌DNA的提取:
                  (一)
                  1.取真菌菌絲0.5g, 在液氮中迅速研磨成粉
                  2.加入4mL提取液,快速振蕩混勻
                  3.加入等體積的4mL的LV:異戊醇(24:1),渦旋3~5min(此處是粗提沒有加酚,可以節(jié)約成本的喲!)
                  4.1000rpm,4℃,5min
                  5.上清用體積的LV:異戊醇(24:1)再抽提一次(10,000 rpm,4℃離心5 min)
                  6.取上清,加入2/3倍體積的-20℃預(yù)冷異丙醇或2.5倍體積的無水乙醇沉淀, 混勻, 靜置約30 min
                  7.用毛細玻棒挑出絮狀沉淀, 用75%乙醇反復(fù)漂洗數(shù)次, 再用無水乙醇漂洗1次, 吹干,重懸于500 ?ulTE中
                  8.加入1 ul RNaseA (10 mg/mL),37℃處理1 hr
                  9.用酚(pH8.0):LV仿:異戊醇(25:24:1)和LV仿:異戊醇(24:1)各抽提1次(10,000 rpm,4℃離心5 min)
                  10.取上清,1/10V 3M NaAc,2.5V體積的無水乙醇, -70℃沉淀30 min以上
                  11.沉淀用75%乙醇漂洗,風(fēng)干, 溶于200 ulTE中,-20 ℃保存?zhèn)溆?/span>
                  DNA提取液:0.2M Tris-HCl(pH 7.5),0.5M NaCl,0.01M EDTA,1%SDS,
                  3M NaAc
                  (二)
                  1.真菌菌絲0.5-1 g, 在液氮中迅速研磨成粉
                  2.加入3 mL 65℃預(yù)熱的DNA提取緩沖液,快速振蕩混勻65℃水浴30 min, 期間混勻2-3次
                  3.加入1 mL 5M KAc,冰浴20 min
                  4.等體積的LV仿:異戊醇(24:1)抽提1次(10,000 rpm,4℃離心5 min)
                  5.取上清,加入2/3倍體積的-20℃預(yù)冷異丙醇, 混勻, 靜置約30 min
                  6.用毛細玻棒挑出絮狀沉淀, 用75%乙醇反復(fù)漂洗數(shù)次, 再用無水乙醇漂洗1次, 吹干,重懸于500 ?L TE中
                  7.加入1 ul RNaseA (10 mg/mL),37℃處理1 hr
                  8.用酚(pH8.0):LV仿:異戊醇(25:24:1)和LV仿:異戊醇(24:1)各抽提1次(10,000 rpm,4℃離心5 min)
                  9.取上清,1/10V 3M NaAc,2.5V體積的無水乙醇, -70℃沉淀30 min以上
                  10.沉淀用75%乙醇漂洗,風(fēng)干, 溶于200 ul TE中,-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/span>

                   

                  注:僅供參考!

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